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gapdh内参不适合做内参(为什么Gapdh内参不适合做内参?)

jk 2023-07-17 12:25:42 906

摘要:为什么Gapdh内参不适合做内参? Gapdh内参简介 Gapdh是糖解酶磷酸化酶的一种,在生物体内广泛分布,是常用的内参基因之一。由于它在多种细胞系和不同生物种中的表达量相对稳定,被

为什么Gapdh内参不适合做内参?

Gapdh内参简介

Gapdh是糖解酶磷酸化酶的一种,在生物体内广泛分布,是常用的内参基因之一。由于它在多种细胞系和不同生物种中的表达量相对稳定,被广泛应用于基因表达研究中。然而,在实际应用过程中,我们发现Gapdh内参也存在一些问题。

Gapdh内参存在的问题

Gapdh作为内参,在基因表达研究中有着很多缺点和限制:

  • 表达水平的变异性较大:虽然Gapdh在很多组织类型中表达水平相对稳定,但在某些特定情况下,例如癌症、糖尿病等疾病状态下,其表达水平会发生变异。因此,在这种情况下使用Gapdh作为内参可能会出现偏差。
  • 表达水平的高低问题:一些研究表明,特定条件下Gapdh的表达水平会受到治疗、细胞压力等因素的影响,其表达量随治疗剂量的升高呈现正相关。此外,Gapdh在肿瘤组织中的表达水平通常较高。因此,当需要比较不同组织或实验组之间的基因表达量时,Gapdh内参也存在一定的不确定性。
  • 检测技术的不同导致数据的不同:由于不同实验室、不同平台之间使用的检测技术存在差异,即便在同一实验条件下,使用Gapdh作为内参所得的数据也可能存在显著差异。因此,对于尚未得到广泛验证的技术,使用Gapdh内参需要谨慎。

替代Gapdh内参的方法

考虑到Gapdh内参存在的这些问题,研究人员提出了使用其他内参来代替Gapdh。常用的代替内参包括Actb、B2m、Rpl13a、Hprt等。这些内参相对Gapdh具有更强的稳定性和表达量均一性,可以保证实验数据的可靠性。在选择代替内参时,需要结合具体实验设计和研究对象情况进行综合考虑,选择最适合的内参。

总的来说,虽然Gapdh作为内参在基因表达研究中有着广泛应用,但其表达水平存在变异性和不确定性,同时受检测技术的影响也会导致数据不准确。因此,在实际应用中,研究人员应该注意其中的缺陷,尝试使用代替内参来保证实验数据的可靠性。

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